Некоторые рыбы светятся в темноте благодаря бактериям-симбионтам, а не генам.

Глубоководные рыбы драконфиш и фотихтис решили проблему производства света принципиально иначе, чем светлячки или медузы. Вместо того чтобы синтезировать люминесцентные молекулы собственными генами, они содержат внутри специальные органы — фотофоры, представляющие собой живые колонии люминесцентных бактерий вида Photobacterium и родственных им. Рыба выращивает эти микроорганизмы, словно живую биолампу, и получает свет как побочный продукт их метаболизма. Бактерии производят биолюминесценцию через химическую реакцию с участием люциферина и люциферазы, но сама рыба никогда не синтезирует эти вещества — она просто поддерживает условия для бактериального сожительства. Такой симбиоз позволяет глубоководным видам экономить энергию: вместо постоянного производства дорогостоящих люминесцентных соединений в собственных клетках, они просто кормят микробов питательными веществами. В обмен бактерии получают защиту, кислород и питательную среду. Фотофоры рыбы могут управлять интенсивностью света, сужая и расширяя кровеносные сосуды вокруг органа или выделяя пигментные экраны. Такой механизм глубоководной люминесценции открывает перспективы в биотехнологии. Люминесцентные бактерии уже используют в лабораторной диагностике и для биологических сенсоров, которые светятся в присутствии определённых токсинов или загрязнений. Механизм симбиоза вдохновляет учёных на разработку гибридных биотехнологических систем, где бактерии работают «на человека» более эффективно, чем клетки млекопитающих.